El infonavit no reconoce relación laboral entre mis trabajadores y la empresa

Tengo una micro-empresa y en 2014 el IMSS me dio de baja inexplicablemente, empresa y trabajadores. Fui a solucionar la situación al subdelegación y todo parecía haber vuelto a la normalidad hasta que un trabajador fue a Infonavit a solicitar un crédito y le dijeron que no tenía relación laboral con ninguna empresa. Yo había seguido pagando cuotas y retenciones normalmente, y fue hasta entonces que me dí cuenta que ninguno de mis trabajadores aparecía con relación laboral. Infonavit dice que eso lo debe solucionar el IMSS, y cuando voy al IMSS dicen que ahí no hay ningún problema, que lo debe solucionar Infonavit. Sin embargo cuando he tenido algún atraso en pago a Infonavit, me requieren el pago relacionándome a los trabajadores con los que, según ellos, no tengo relación laboral. En ninguno de los dos institutos logro solucionar ésto, ¿qué puedo hacer? Gracias de antemano.