¿El fondo de ahorro sigue corriendo en incapacidad?

Debería porque es parte del sueldo y Usted no esta faltando, ni en periodo vacacional, pero de no ser posible que se lo otorguen en la empresa, la única manera en la que podrá obligarlos es demandándolos ante la junta de conciliación o la Procuraduría de la defensa del trabajo, lo que necesaria y desgraciadamente hace que los patrones se arriesguen a despedirle, pero aun así le deberán indemnizar conforme la ley. Si su patrón es consiente debe aceptar su negociación. Si esta dispuesto a todo por hacer valer su derecho, contrate a un Abogado, o acuda a la defensa del trabajo.